Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms