Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.9 ms