Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms