Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mrpl39Q9JKF7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mrpl39Q9JKF7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mrpl39Q9JKF7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mrpl39Q9JKF7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mrpl39Q9JKF7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mrpl39Q9JKF7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mrpl39Q9JKF7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Mrpl39Q9JKF7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Mrpl39Q9JKF7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mrpl39Q9JKF7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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Mrpl39Q9JKF7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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