Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tmod3Q9JHJ0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tmod3Q9JHJ0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod3Q9JHJ0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tmod3Q9JHJ0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tmod3Q9JHJ0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tmod3Q9JHJ0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tmod3Q9JHJ0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tmod3Q9JHJ0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmod3Q9JHJ0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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