Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms