Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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