Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms