Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms