Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smg9Q9DB90 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smg9Q9DB90 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smg9Q9DB90 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smg9Q9DB90 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smg9Q9DB90 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smg9Q9DB90 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smg9Q9DB90 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smg9Q9DB90 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smg9Q9DB90 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smg9Q9DB90 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smg9Q9DB90 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms