Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ift43Q9DA69 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ift43Q9DA69 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ift43Q9DA69 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ift43Q9DA69 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ift43Q9DA69 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ift43Q9DA69 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ift43Q9DA69 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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