Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms