Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Subh2bvQ9D9Z7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Subh2bvQ9D9Z7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Subh2bvQ9D9Z7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Subh2bvQ9D9Z7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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