Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Cyp2c55Q9D816 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cyp2c55Q9D816 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cyp2c55Q9D816 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cyp2c55Q9D816 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms