Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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