Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Echdc3Q9D7J9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms