Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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