Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
4930564D02RikQ9D4S4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930564D02RikQ9D4S4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms