Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms