Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms