Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt20Q9D312 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms