Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms