Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms