Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms