Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms