Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rfc5Q9D0F6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfc5Q9D0F6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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