Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms