Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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