Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxxc1Q9CWW7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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