Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms