Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms