Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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MINDY3Q9CV28 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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MINDY3Q9CV28 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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MINDY3Q9CV28 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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MINDY3Q9CV28 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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MINDY3Q9CV28 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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MINDY3Q9CV28 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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MINDY3Q9CV28 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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MINDY3Q9CV28 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MINDY3Q9CV28 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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