Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lhfpl3Q9CTN8 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms