Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d3Q9CSV6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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