Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms