Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms