Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rdm1Q9CQK3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rdm1Q9CQK3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rdm1Q9CQK3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Rdm1Q9CQK3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms