Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms