Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms