Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nudt21Q9CQF3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms