Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl11Q9CQF0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms