Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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