Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms