Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Use1Q9CQ56 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Use1Q9CQ56 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Use1Q9CQ56 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Use1Q9CQ56 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Use1Q9CQ56 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Use1Q9CQ56 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Use1Q9CQ56 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Use1Q9CQ56 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Use1Q9CQ56 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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