Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl17Q9CPR4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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