Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mrpl43Q99N89 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Mrpl43Q99N89 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Mrpl43Q99N89 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Mrpl43Q99N89 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Mrpl43Q99N89 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Mrpl43Q99N89 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Mrpl43Q99N89 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Mrpl43Q99N89 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Mrpl43Q99N89 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Mrpl43Q99N89 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl43Q99N89 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms