Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms