Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Epdr1Q99M71 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Epdr1Q99M71 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Epdr1Q99M71 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Epdr1Q99M71 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Epdr1Q99M71 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Epdr1Q99M71 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Epdr1Q99M71 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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