Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms