Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms